W dniu 03 kwietnia 2014 roku, w Warszawie odbyło się seminarium zatytułowane „Innowacyjne zastosowania przełomowej technologii Biolog do identyfikacji i fenotypowania mikroorganizmów”.
Spotkanie, które miało miejsce na Wydziale Biologii UW zorganizowała biotechnologiczna firma BioMaxima, mająca swoją siedzibę w Gdańsku. Kluczowym produktem oferowanym przez Biomaximę jest system diagnostyczny Biolog. Na seminarium był obecny dr Barry R. Bochner – twórca i propagator wykorzystania systemu do identyfikacji i badania fizjologii mikroorganizmów. W seminarium wzięło udział około 35 osób z całej Polski. Referaty wygłosili między innymi Pani dr hab. Maria Nieklińska i dr Beata Klimek z Instytutu Nauk o Środowisku UJ, dr hab. Grażyna Płaza z Instytutu Ekologii Terenów Uprzemysłowionych z Katowic oraz dr hab. Izabela Sitkiewicz z Narodowego Instytutu Leków z Warszawy. Środowisko mykologów reprezentowała dr Karolina Oszust z zespołu dr hab. Magdaleny Frąc z Instytutu Agrofizyki PAN z Lublina, prof. dr hab. Małgorzata Jędryczka z Instytutu Ochrony Roślin PIB z Poznania i Agnieszka Banach z Uniwersytetu Warszawskiego. Uczestnicy seminarium prezentowali swoje doświadczenia z wykorzystania płytek Biolog. Najkrócej rzecz ujmując system Biolog opiera się na badaniu spektrofotometrycznym próbek, które stanowią mikrokolumienki z pożywkami o określonych cechach, które zostały inokulowane przez zawiesinę mikroorganizmów – bakterii bądź zarodników grzybów. Czytniki płytek odbierają sygnał o odpowiedzi mikroorganizmów na czynniki chemiczne bądź fizyczne, która jest pochodną wzrostu organizmu w kolumienkach. System Biolog oferuje różne zestawy badawcze: płytki zawierające różne źródła węgla, azotu, siarki i fosforu, ale również płytki badające odporność na toksyny czy wzrost przy zadanym odczynie. Płytki można badać zarówno w warunkach tlenowych jak i mikroaerobowych po umieszczeniu płytki w folii po zastosowaniu vaccum. Dr Berry Bochner skupił się na prezentacji wachlarza badawczych zagadnień, które mogą znaleźć przydatne narzędzie w oferowanym systemie. Interesującym zagadnieniem poruszanym przez prelegenta było wykazanie jak zestaw pływek pozwala w krótkim czasie zoptymalizować warunki do wzrostu kilku mikroorganizmów o nieco odmiennych wymaganiach środowiskowych na przykładzie Saccharomyces cerevisiae i Dekkera bruxellenisis, dwóch drożdżaków, które biorą udział w fermentacji wina. Dekkera jest z reguły uznawana za organizm niepożądany, ponieważ dostarcza dodatkowych aromatów – nieprzyjemnych w zbyt dużym stężeniu, ale bardzo wzbogacającym bukiet – w niewielkim stężeniu. Optymalizacja warunków fermentacji napojów alkoholowych jest więc biotechnologicznie ważnym zagadnieniem. Pani dr Karolina Oszust skupiła się natomiast na prezentacji wykorzystania płytek do badań ekologii mikroorganizmów glebowych. Pokazała uczestnikom seminarium jak można stosować narzędzie jakim jest system do badań zarówno pojedynczych organizmów jak i całych zespołów mikroorganizmów glebowych. Omówiła szereg wskaźników ekologicznych, które oferuje oprogramowanie Omnilog współpracujące z czytnikiem płytek. Agnieszka Banach zaprezentowała zupełnie odmienny problem. Celem jej pracy jest wykorzystanie płytek do mapowania cech fizjologicznych na drzewie filogenetycznym. Spotkanie miało charakter roboczy i wydaje się, że uczestnicy naprawdę nawiązali wartościowe kontakty sadząc z burzliwych dyskusji toczących się w kuluarach pomiędzy osobami zainteresowanymi nową techniką. (opracowanie tekstu: Marta Wrzosek)